医学实验室设计的空间布局应该严格遵循以下原则：功能分区科学、布局流程合理、洁污路线清楚等。
一、功能分区科学
医学实验室在总体设计上，必须明确划分清洁区、半污染区（缓冲区）和污染区，各区之前必须有明确的物理隔断或围护结构。
1、清洁区是指相对的清洁区域，包括办公、学习和工作人员休息的区域。
2、半污染（缓冲区）是指污染的风险度较低，或者指处于清洁区和半污染区之间的过渡区域。
3、污染区又称实验防护区，该区域内生物风险相对较大。需对实验室的平面设计、围护结构的密闭性、气流，以及人员进入、个体防护等进行控制的区域。
二、布局流程合理
医学实验室在总体设计上，必须重视和优化布局流程。布局流程合理必须充分体现下述原则:
1、较短路径原则：医学实验室设计时必须考虑路径较短，即让工作人员走较短的路，做较多的工作，只有如此才能体现功效较大化。同时，实验室的路径设计还应充分考虑病人的方便，较大限度地体现对病人的“一站式”医学检验服务。
2、污染梯度原则：实验室设计时应考虑各实验单元的风险度，污染程度越轻的实验单元应越靠近清洁区域；污染程度越重的实验单元应越远离清洁区域。
三、洁污路线清楚
医学实验室设计时必须首先考虑并确定污物通道。然后根据既定的污物通道设计各实验单元和人流物流通道。要做到：
1、人流物流分道设计。
2、病人和工作人员分道设计。
3、清洁物品和污染物品分道设计。
4、污物通道应较大限度避开公共通道和实验室的清洁区。
5、污物通道要靠近污物电梯。
